Поступила в редакцию: 5 января 2025 г.
Принята к публикации: 10 февраля 2025 г.
Опубликована online: 28 марта 2025 года
УДК: 616-056.7-073:579.873.2
DOI: 10.26212/2227-1937.2025.25.63.024
Н.К. Такенов, Л.Т. Чингисова, В.Л. Бисмилда,
А.А. Казиев, З.М. Шамурова
Национальный научный центр фтизиопульмонологии МЗ РК, Алматы, Республика Казахстан
АНАЛИЗ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS МЕТОДОМ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ
Введение: Туберкулёз остается одним из ведущих инфекционных болезней, с высокой смертностью и социальной
значимостью в мире. В последние годы особое внимание уделяется исследованию геномных вариаций Mycobacterium
tuberculosis, которые влияют на вирулентность, устойчивость к лекарствам и передачу инфекции. В Казахстане
ситуация осложняется наличием штаммов с множественной и широкой лекарственной устойчивостью.
Цель исследования: Определение наиболее распространенных линий Mycobacterium tuberculosis, и выявление
мутаций, ассоциированных лекарственной устойчивостью на основе данных секвенирования.
Материалы и методы: В исследовании использовались клинические изоляты, собранные в 2023 году. Для
полногеномного секвенирования культуры были рекультивированы на среде Левенштейна-Йенсена и выделена
ДНК. Библиотеки готовили с Nextera XT DNA Library Prep Kit (Illumina) и секвенировали на платформе Illumina MiSeq
(MiSeq Reagent Kit v3, 600 циклов). Полученные данные анализировали с помощью TB-Profiler и MTBseq для
определения SNPs, инделов и построения филогенетического древа.
Результаты: В ходе исследования было собрано и проанализировано 120 клинических изолятов M. tuberculosis,
выявленных у пациентов, проходивших лечение в Национальном Научном Центре Фтизиопульмонологии в Алматы,
Казахстан. Анализ полученных данных позволил охарактеризовать популяционную структуру M. tuberculosis в
регионе. Самыми частыми были генотипы L2/Beijing (79/120; 65,8%) и L4/Euro-American (40/120; 33,3%). Выявлена
устойчивость к стрептомицину (53/120; 44,2%), изониазиду (46/120; 38,3%), этамбутолу (37/120; 30,8%),
рифампицину (29/120; 24,2%) и пиразинамиду (15/120; 12,5%). Распространённой мутацией, ассоциированной с
устойчивостью к рифампицину, была rpoB S450L (23/28; 82,1%). Мутация katG S315T выявлена у 97,8% (45/46)
штаммов, устойчивых к изониазиду.
Обсуждение: Полученные данные демонстрируют наибольшее распространение линии M. tuberculosis L2/Beijing,
которая ассоциируется с высокой вирулентностью и устойчивостью к противотуберкулёзным препаратам. Наиболее
часто встречается устойчивость к стрептомицину (44,2%), изониазиду (38,3%) и этамбутолу (30,8%), а рифампицинрезистентность выявлена у 24,2% изолятов. Высокая частота мутаций rpoB S450L и katG S315T среди устойчивых
изолятов указывает на их ключевую роль в развитии лекарственной устойчивости.
Выводы: Исследование подчеркивает необходимость усиленного мониторинга и применения современных
молекулярных технологий для контроля за распространением туберкулёза в регионе.
Ключевые слова: Туберкулёз, Mycobacterium tuberculosis, геномное секвенирование, лекарственная устойчивость,
Казахстан.
